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媒介生物采樣箱由吸血雙翅目昆蟲采樣和鼠類及蚤蜱螨類采樣箱組成。主要配置蚊蟲二氧化碳誘集系統、嚙齒類動物（主要是鼠類）體外寄生蟲采集包、捕鼠器包及其它應用器具。
蚊蟲二氧化碳誘集系統主要采集、保存蚊蟲標本；嚙齒類及體外寄生蟲采集包主要采集、保存嚙齒類動物、蚤、蜱等標本，用于病原檢測和分離。
該箱體內主要配置包括鼠夾、吸蚊器、放大鏡、手電、鼠袋、采蜱布旗、采蚤布旗。此外還配置有乳膠手套、一次性帽子、一次性口罩、解剖器械包、包裝塑料袋、蓄電池、昆蟲樣品收集器、二氧化碳鋼瓶、誘蚊燈防雨罩、標記筆、簽字筆等。
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